本書是軒轅（yuán）訣係（xì）列的第二部。緊接第一部（bù）的故事，馮慎一（yī）邊追凶（xiōng）查（chá）案，一麵（miàn）拚力（lì）與隱藏在暗處的敵對勢（shì）力斡旋（xuán）。經曆同僚背叛，民眾無辜慘（cǎn）死後，事態逐步升級。先（xiān）是天理邪教（jiāo）與粘杆餘黨的糾纏，再是朝（cháo）中權臣與日本勢力的傾軋，最終朝廷也得（dé）知《軒轅訣》尚在世間（jiān）的傳聞，派遣大內侍衛對（duì）馮慎（shèn）咄咄相逼……在幾方勢力的覬（jì）覦（yú）下，馮慎身陷重圍。當（dāng）走投無路之時，“死（sǐ）去”多年的馮父突然出現（xiàn），並協（xié）同三名神秘人擊退了追兵。追（zhuī）兵擊退（tuì）後，馮父也（yě）重傷不治。在彌留之際，馮父（fù）對馮慎說出了令人驚訝的（de）往事（shì），並且將馮慎（shèn）托付（fù）給同來的神秘人。在肅親王和那些（xiē）神秘人的幫助下，馮慎（shèn）化險為夷，以假（jiǎ）死逃出了京師。逃出後，馮慎得知了三名神秘人的身份（fèn）。